I D E E T P E G K A F L L K L R E I L E T E D K N A P V S S E S S S S S R R S R 1076
۳۲۴۱ GGAGCAGCAGCAGCAGCAGTTCAAGCTCCTCCATGTCCAGCTCTCGTATGAGTAAGACTGCCACCATCATGGAGCCCTTCAGGAAGTTCCACAAAGACCGGTTCTTGGCACCCCATGGTG
S S S S S S S S S S M S S S R M S K T A T I M E P F R K F H K D R F L A P H G A 1116
۳۳۶۱ CCTCAAAGGCAGTAAGCAGTGGAAGCACTGCATCTAGCTTTGAGGCTCTACAGAAACAGGCTAAGTTCCTCGGAAATGCTCTTCCACCTGTTTTTGCTGTCATTGCCCGTGCTGTGAGAG
S K A V S S G S T A S S F E A L Q K Q A K F L G N A L P P V F A V I A R A V R V 1156
۳۴۸۱ TTGACCACAAGCTGCTGGGCTACCAACTTGCTGCTTACTTTGACAAGCCAACAGCAAGAGTGCAGCTCGTTGTTTCCTCCATCGCTGAAAATGACAACCTGAAGATCTGTGCTGATGGTG
D H K L L G Y Q L A A Y F D K P T A R V Q L V V S S I A E N D N L K I C A D G A 1196
۳۶۰۱ CCGTGCTGAGCAAGCACAAAGTCACTGCCAAGGTTGCTTGGGGTCAAGAATGCCAACAGTATGCAGTCACTGCTAAAGCTGAAGCCGGTGTCCTGGGCGAATTCCCTGCTGTACGTCTAG
V L S K H K V T A K V A W G Q E C Q Q Y A V T A K A E A G V L G E F P A V R L E 1236
۳۷۲۱ AGCTGGAATGGGAGAGGCTGCCAATAATTGTCACCACATACGCCAAAAAGCTGTCGAAGCACATCCCTATGGCGGCTTTCCAGACGGGCTTTAGACTAGAAAGAGCCACGAACAGTGAGA
L E W E R L P I I V T T Y A K K L S K H I P M A A F Q T G F R L E R A T N S E K 1276
۳۸۴۱ AAGAGATTGAACTGACTGCAGCCTTGCCAACTCAGAGATCCTTGAATGTCATTGCTAGGATTCCAGAGATGACACTGTCAAGGATGGATATTCGTCTCCCTGTCGCTGTTCCCATCAATC
E I E L T A A L P T Q R S L N V I A R I P E M T L S R M D I R L P V A V P I N P 1316
۳۹۶۱ CAGACGGAACTCTTTCCATTCATATCGATGAGGACATTCTCTCCTGGATCCAGAAACATTTCAAGGAAGAATAAGACATCAAGAATTACATTTCATATTTTCTTAAGAAATGTGAGCTGT
D G T L S I H I D E D I L S W I Q K H F K E E 1339
۴۰۸۱ GTGGAATTGATCATGCTGAATTGATTGTTCTTTGACAATTTTATTTAATTTTACCACAGTTGTAATGCAAGTAACAGTAATAAACACCCTGCAAGTG Poly-A
شکل۴-۶) توالی نوکلئوتید (اعداد سمت چپ) و آمینواسید (اعداد سمت راست) ویتلوژنین در P. esfahani. کودون­های آغاز و پایان به شکل پررنگ و زیرخط­دار نشان داده شده ­اند. تمام آغازگرها به صورت زیرخط­دار نشان داده شده ­اند (به جز آغازگرهای QPCR) و پیکا­ن­ها نمایان­گر جهت آن­ها هستند. Poly-A به صورت زیرخط­دار باخط ضخیم­تر، قطعه میانی با قلم خاکستری پررنگ (۹۳۴ bp)، ۵’ UTR (خاکستری) دارای طول ۱۴ bp، ORF (پررنگ) دارای طول ۴۰۲۰ bp و ۳’UTR (خاکستری) تا Poly-A tail دارای ۱۴۲ bp است. آغازگرهای مستقیم و معکوس مربوط به تکثیر هر قطعه با یک رنگ مشخص شده است.
۴-۵-۳- توالی کامل cDNA بتا-اکتین در P. esfahani
توالی کامل cDNA بتا-اکتین با ادغام توالی­های َ۳، میانی و َ۵ برای اولین بار در عروس­ماهی زاینده­رود به دست آمد. این توالی دارای ۱۷۷۶ bp طول (بدون در نظر گرفتن Poly-A) و پروتئین آن دارای ۳۷۵ آمینواسید است (شکل ۴-۷). میزان شباهت توالی کامل نوکلئوتید و آمینواسید بتا-اکتین در عروس­ماهی زاینده­رود با سایر گونه­ ها از طریق بلاست آن در NCBI، در جداول ۴-۱۱ و ۴-۱۲ نشان داده شده است.

( اینجا فقط تکه ای از متن فایل پایان نامه درج شده است. برای خرید متن کامل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت feko.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. )

جدول ۴-۱۱) میزان شباهت توالی کامل نوکلئوتید بتا-اکتین در P. esfahani با برخی دیگر از گونه­ ها.

نام معمول
نام علمی
ژن
شباهت (%)
شماره دسترسی

گور­خرماهی

Danio rerio

β-actin 2

۹۷

BC045306

سس­ماهی منقوط

Hemibarbus mylodon

β-actin 1

۹۷

EF554924

زردچانه

Elopichthys bambusa

β-actin 2