علائم بیماری
حدود ۱۰۰ گونه گیاه تک لپه حساس به ویروس مورد بحث شناسایی شده اند اما علائم بیماری در آنها متفاوت است . معمولاً علائم بیماری در جو نسبت به یولاف شدت کمتری دارد و گندم از این لحاظ حد و سط است و در بعضی از میزبان ها هیچ گونه علائمی مشاهده نمی شود .
برای ظهورعلائم بیماری مناسب است. ۱۸-۱۵ )cنورزیاد ( بالاتر از ۱۲۰۰۰ لوکس ) و در دمای نسبتاً پایین (
(( اینجا فقط تکه ای از متن درج شده است. برای خرید متن کامل فایل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت nefo.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. ))

) ۳۰cدما در بروز علائم در گیاهان مایه زنی شده اهمیمت زیادی دارد به طوری که در دماهای بالا ( بالاتر از
علائمی مشاهده نمی شود .
یکی از علائم بیماری ، کوتولگی ناشی از کاهش فاصله میانگره ها می باشد . ممکن است کوتولگی خیلی شدید باشد به طوری که مانع از تشکیل خوشه شود اما در بعضی موارد کوتولگی شدت زیادی ندارد . تنها در مقایسه با گیاه سالم قابل تشخیص است . مهمترین علائم برگی کاهش سبزینه گیاه است که بیشتر در برگهای مسن و پیر مشاهده می شود . بافت سبز برگهای مسن بطور نامنظم و معمولاً در امتداد حاشیه یا از نوک برگ ، شروع به تغییر رنگ می کند .
نواحی تغییر رنگ داده گسترش یافته و به هم متصل می شود . و سرانجام زردی کل برگ را فرا می گیرد . همچنین گاهی در برگها حالت آب سوخته مشاهده می شود . در گیاهان آلوده پنجه زنی کاهش می یابد ، از تولید خوشه و پر شدن دانه جلوگیری می شود . گلها عقیم شده و نسبت به گیاهان سالم کوچکتر می مانند . ممکن است گل آذین دیرتر تشکل شود و تعداد و وزن دانه ها کاهش یابد . در نتیجه بروز علائم ذکر شده عملکرد گیاه کاهش می یابد .
علائمی نظیر داندانه ای ستون حاشیه برگها در گندم و یولاف گزارش شده است . برگهای آلوده معمولاً راست تر از برگهای سالم می ایستند .
اغلب در جو برگها به رنگ زرد روشن در می آید که از نوک و حاشیه برگها شروع شده و به سمت قاعده برگ گسترش می یابد . در یولاف برگها به رنگ قرمز یا ارغوانی در می آید . در گندم ، چاددار ، ترتیکاله برگها به رنگ قرمز ، ارغوانی یا زرد در می آید . در برنج برگها به رنگ زرد روشن یا نارنجی دیده می شود ، BYDV-در ذرت ، نوک و حاشیه برگهای پایین به رنگ قرمز ، صورتی و زرد مشاهده می شود . جدایه هایی از
در ارتباط با بیماری زردی برگ نیشکر تشخیص داده شده است که باعث زردی ، قرمزی و رشد نامنظمPAV
نیشکر می شود .
در ایران علائم قرمزی برگ گندم آلوده به ویروس در مناطق سلطانیه و زنجان و اقلید و باجگاه در استان فارس مشاهده گردید . در جو علائم زردی و کوتولگی قابل تشخیص است .
دامنه میزبانی :
هستند . بسیاری از گیاهان یک ساله و دو ساله Gramineaeویروس های عامل کوتولگی زرد محدود به تیره
غیر زراعی ، غلات دانه ریز ، علف های هرز ، گیاهان مرتعی و گروهی از گراس ها میزبان ویروس های عامل
بیماری کوتولگی زرد هستند . این ویروس ها در گراس های چند ساله نیز مشاهده می شوند . میزبانهای زراعی ،(Arena satiral.) یولاف (zea maysl.) ، ذرت (Hordam valgare L.)این ویروس ها شامل جو
، گندم دوروم(Triticum aestivum) گندم گنان (secale cereal) ، چاددار (oryza satiraL.)برنج
می باشد . (sorghum halepense L.) ، ترتیکاله (T.durum)
تاکنون گزارشی از حساسیت گیاهان دو لپه ای به این بیماری وجود ندارد . اما در ایران جو ، گندم ، یولاف ، ذرت ، قیاق ، مرغ و لوسیوم به عنوان میزبان های این ویروس گزارش شده اند .
عامل بیماری :
می باشد . (lu teoriridae) ویروس عامل بیماری کوتولگی زرد جو از تیره لوتئوریریده
به معنی زردی مشق شده است که بیانگر نوع علائم ایجاد شده توسط این “ liteus “نام تیره از کلمه لاتین
Enamo virus ,Polero virus , luteo virusویروس ها است . ویروس های این خانواده به سه جنس
طبقه بندی می شوند . ویروس عامل کوتولگی زرد جو براساس بررسی های فیلوژنتیکی ، ترادف اسیدهای
قرار می گیرند .Luteo viros , Polero virusآمینه پلیمر از و پروتئین پوششی در دو جنس
به قطر ۲۵ نانومتر می باشد . ژنوم ویروس آر.ان.ای تک لا ،T=3پیکره لوتئو ویروس ها ایزومتریک با تقارن
مثبت ، یک بخشی و فاقد غلاف یپوپروتئینی است .
آر.ان.ای ۲۸ تا ۳۰ درصد پروتئین ۷۰ تا ۷۲ درصد وزن کل پیکره را تشکیل می دهد . پیکره ها استحکام متوسطی دارد . و به تیمار با کلروفرم و شوینده های غیر یونی غیر حساس ، اما به تیمار با غلظت بالای نمک
برای مدت طولانی حساس می باشند . پیکره ها به انجماد حساس نیستند . پایداری ویروس دریافت های خشک شنده در هوای اتاق که بعداً در دمای ۱۰ – درجه سانتی گراد نگهداری می شوند ، نسبت به بافت هایی که مستقیماً در دمای ۲۰ – درجه سانتی گراد نگهداری شده اند یا بافت هایی که بعد از خشک شدن در دمای اتاق قرار داده شده اند بیشتر است .
روش های تشخیص و شناسایی ویروس های گروه کوتولگی زرد جو
۱ ـ روش بیولوژیکی
براساس خصوصیات بیولوژیکی و به خصوص نسته های ناقل BYD در ابتدا تشخیص ویروس هایی گروه
انجام شد . همچنین از نوع علائمی که این ویروسها روی میزبانان مختلف ایجاد می کنند نیز استفاده می شد علی رغم سادگی به دلیل که وقت گیر بوده و نیاز به تجهیزات و فضای زیاد دارند همچنین به این دلیل که گاهی علائم حاصله با علائم ناشی از سایر عوامل از جمله عوامل غیر زنده محیطی اشتباه می شوند زیاد ، قابل اطمینان نیستند .
۲ ـ روش سرولوژیکی
که در آن آنتی بادیهای چند همسانه ای استفاده می شود را نام DAS-ELISAاز جممله این روش ها می توان
از آنتی بادی یک همسانه ای استفاده می شود .TAS-ELISAبرد در
که در آن پیکره های ویروسی موجود در برشهایی از بافت گیاه آلوده Tis sue-blot immunoassay
روی غشاء نیتروسلولز یا نایلون کله گذاری می شوند ،
که در آن پیکره ویروس توسط آنتی (Serologically specific electron microscopy CSSEM)
بادی قرار گرفته روی گردید به دام افتاده و پس از رنگ آمیزی در میکروسکوپ الکترونیکی مشاهده می شود،
که در آن از ذرات طلا برای ردیابی ویروس دربافت گیاهی و یا Immunogold labeling technigue
داخل بدن نسته ناقل استفاده می شود .
از دیگر روش های سرولوژیکی هستند .
۳ ـ روش مربوط به نولئیک اسید
که برای تشخیص آر.ان.ای در Dot-blot hyoridizationروش های قابل ذکر در این رسته عبارتند از
ویروس خالص شده یا بافت آلوده استفاده می شود .
که در آن از آغازگرهای عمومی تیره لوتئوویریده و آغازگرهای اختصاصی بعضی جدایه های RT-PCP
و تشخیص در بافت رشته ناقل و تعیین ترادف ژنوم استفاده می شود .BYD
مقایسه بین روش های تشخیص و ردیابی ویروس
ازRT-PCPروش های زیادی برای تشخیص و ردیابی لوتئو ویروس ها وجود دارد که در میان آنها روش
حساسیت بالاتری برخوردار است . با وجود این روش معمول استفاده در اکثر آزمایشگاه ها زیرا نیاز به تجهیزات و دستگاه های گران قیمت ندارد و در سطح وسیع قابل استفاده می باشد و در عین حال از حساسیت خوبی برخوردار است . اما به طور کلی جهت انتخاب روش تشخیص مناسب باید توجه داشت که روش انتخاب شده باید آسان ، ارزان قیمت ، با حساسیت بالا و قابل اطمینان باشد .
انتشار بیماری کوتولگی زرد جو :
دامنه BYD غلات در سارسر دنیا از اهمیت ویژه ای برخوردار می باشد . ویروس های کوتولگی زرد جو

نکته۲: به موجب نظریه مشورتی شماره ۸۶۵/۷-۱۹/۲/۱۳۷۹ اداره حقوقی قوه قضائیه:
“وظایف هیات نظارت در ماده ۲۵ قانون ثبت و بندهای هشت گانه و تبصره های آن ذکر شده است و ابطال سند انتقال صادره جزء وظایف هیات نیست و چون مرجع رسمی تظلمات، مراجع قضایی است لذا ابطال سند انتقال مذکور به فرض این که قابل پذیرش باشد در صلاحیت دادگاه عمومی محل وقوع ملک است”
نکته ۳: رای هیات موضوع مواد ۱۴۷ و ۱۴۸ اصلاحی مقدمه برای صدور سند مالکیت است. وقتی شخصی، خواهان ابطال سند مالکیت باشد دادگاه می تواند به مقدمات خواسته نیز رسیدگی کند و لازم نیست که خواهان تصریح کند که فسخ رای هیات جزئی از خواسته اوست. برخی موضوعات هر چند قابلیت رسیدگی مستقل دارند ولی خود می تواند مقدمه بعضی از دعاوی باشند.

( اینجا فقط تکه ای از متن فایل پایان نامه درج شده است. برای خرید متن کامل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت feko.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. )

به عنوان مثال: در دعوای الزام به تنظیم سند رسمی با وجود این که خواهان اثبات مالکیت خود را تصریح نکرده ولی دادگاه بدواً به مالکیت خواهان رسیدگی و پس از احراز آن، خوانده را ملزم به تنظیم سند رسمی کند و چون اعتراض به ثبت (یا رای هیات حل اختلاف) ملازمه با ادعای مالکیت دارد فلذا لزومی به تصریح عناوین ابطال یا فسخ رای کمیسیون مواد ۱۴۷ و ۱۴۸ نمی باشد چون قبول تقاضای خواهان، مستلزم ابطال رای کمیسیون مذکور است^[۵۳].
۲-۳ ابطال سند مالکیت در صورت ملغی الاثر شدن تصمیم کمیسیون تشخیص ماده ۱۲ قانون زمین شهری
اصل چهل و پنجم قانون اساسی ایران، (زمین های موات یا رها شده) را از جمله انفال و ثروتهای عمومی قلمداد و آنها را در اختیار حکومت اسلامی قرار داده است تا بر طبق مصالح عامه نسبت به آن ها عمل شود.
ماده ۳ قانون زمین شهری^[۵۴] اراضی موات شهری را تعریف نموده و ویژگیهای آن را اعلام داشته است، لذا تشخیص زمین موات برای استقرار مالکیت دولت شرط ضروری و لازم می باشد. به علاوه حسب مقررات آمره، به منظور جلوگیری از تخریب باغات و فضای سبز در محدوده قانونی شهرها که در محیط زیست موثر خواهد بود تشخیص باغ ونوعیت دایر بودن زمین ضروری به نظر می رسد.
در این راستا ماده ۱۲ قانون زمین شهری مصوب سال ۱۳۶۶ مقرر می دارد: “تشخیص عمران و احیاء و تاسیسات متناسب و تعیین نوع زمین دایر و تمیز بایر از موات به عهده وزارت مسکن و شهر سازی است این تشخیص قابل اعتراض در دادگاه صالحه است ” مواردی که تشخیص نوعیت اراضی ضروری و اشخاص حقیقی یا حقوقی مکلف به اخذ نظریه وزارت مسکن و شهر سازی در خصوص نوع زیست زمین شده اند عبارتند از:

1. 1. در صدور مجوز یا پروانه

1. 1. در نقل و انتقال

1. 1. در افراز وتفکیک و تقسیم اراضی شهری

1. 1. در تملک اراضی

** ماده واحده الحاقی به ماده ۱۲ قانون زمین شهری مصوب ۳/۱۱/۱۳۷۰ مجمع تشخیص مصلحت نظام^[۵۵]
“وزارت مسکن و شهر سازی مکلف است نظریه خود را در تشخیص نوع زمین اعم از آنچه تا کنون صادر نموده و به آن اعتراض نشده یا آنچه بعداً صادر می نماید به مالکین اعلام نماید.
مهلت حق اعتراض از تاریخ اعلام سه ماه تعیین می گردد و در صورت عدم دسترسی یا استنکاف مالک از دریافت نظریه بایستی طی دو نوبت به فاصله ده روز نظریه مذکور در روزنامه کثیرالانتشار آگهی شود. تا سه ماه از تاریخ آخرین آگهی، مدعیان می توانند اعتراض خود ر به دادگاه تسلیم نمایند. در صورت عدم وصول اعتراض در مهلت مذکور تشخیص، قطعی و لازم الاجراست”.
این ماده علی رغم مخالفتی که با قانون زمین شهری دارد به لحاظ اینکه دولت و خریداران زمین از دولت را از سر درگمی و بلاتکلیفی درآورده است مصداق مصلحت نظام و از موارد عسر و حرج بوده و راهگشا می باشد.
۲-۳-۱ مصوبات مجمع تشخیص مصلحت نظام، وضعیت حقوقی اراضی موات و بایر
در حال حاضر با توجه به مصوبات مجمع تشخیص مصلحت نظام، وضعیت حقوقی اراضی موات و بایر به شرح زیر می باشد:
۲-۳-۱-۱ زمین های موات
به موجب “قانون مرجع تشخیص اراضی موات و ابطال آن در محدوده خارج از شهرها مصوب ۲۵/۵/۱۳۶۷ مجمع تشخیص مصلحت نظام” و نیز “قانون زمین شهری” در داخل محدوده شهر ها جزو انفال بوده و در اختیار دولت قرار دارد.
تشخیص موات بودن اراضی داخل در محدوده شهرها با وزارت مسکن و شهرسازی و خارج از محدوده شهر ها با جهاد کشاورزی است. این تشخیص قابل اعتراض و رسیدگی در دادگاه صالحه است.
۲-۳-۱-۲ اراضی بایر
هم اکنون قانون لازم الاجرا ی اراضی بایر خارج از محدوده شهر ها، مصوبه مجمع تشخیص مصلحت نظام در خصوص (حل مشکل اراضی بایر )^[۵۶] است. که تغییراتی در وضع حقوقی اراضی بایر خارج از محدوده شهر ها به عمل آورده است.
تبصره ۱ ماده ۱۲ قانون زمین شهری مصوب سال ۱۳۶۶^[۵۷] هیچ اظهار نظری در خصوص قطعیت حکم صادره دادگاه نکرده و بنا به مقررات قانون آئین دادرسی مدنی این احکام قابل تجدید نظر می باشند.
به موجب تبصره ۲ ماده ۱۲ قانون زمین شهری، ملاک تشخیص مرجع مقرر در ماده ۱۲، در موقع معاینه محل در مورد نوع زمین هایی که از تاریخ ۲۲/۱۱/۱۳۵۷ به وسیله دولت یا ارگانها و دفاتر خانه سازی، احداث اعیانی یا واگذار شده، بدون در نظر گرفتن اعیان های مذکور خواهد بود.
۲-۳-۲ ترکیب اعضای کمیسیون
مبنای وجود کمیسیون تشخیص ماده ۱۲ قانون زمین شهری بوده که در ادارات کل مسکن و شهر سازی مراکز استان ها تشکیل و به وظایف مقرر در این ماده عمل می نماید.
در گذشته قانون زمین شهری مصوب ۱۳۶۰ و آئین نامه اجرای آن اعضای کمیسیون و نحوه تشکیل جلسات را پیش بینی کرده بود. ولی با تصویب قانون زمین شهری در سال ۱۳۶۶ این آئین نامه اعتبار خود را از دست داده و هم اکنون آئین نامه اجرایی قانون زمین شهری مصوب ۲۴/۳/۱۳۷۱ که به تصویب هیات وزیران رسیده لازم الاجرا می باشد که در آن هیچ اشاره ای به ترکیب اعضای کمیسیون نکرده است.
بر اساس دستورالعمل وزارت مسکن و شهر سازی، تشخیص نوع زمین به عهده ۳ نفر که با حکم وزیر مسکم و شهر سازی تعیین می شوند می باشد. در شهر ها ی بزرگ ه نمایندگان وزیر مذکور متعدد هستند حسب مورد به گروه های سه نفره تقسیم می شوند و هر گروه با توجه به اینکه در قانون اراضی شهری، کمیسیون نادیده شده بود به اعتبار سابقه تقنینی به کمیسیون ماده ۱۲ معروف است.
این کمیسیون دارای دبیرخانه ای است که در مرکز هر استان واقع شده و وظیفه ضبط نظرات و پاسخ استعلامات و تهیه وسایل و ملزومات نمایندگان وزیر به عهده درد. دبیخانه از ناحیه رئیس سازمان مربوطه منصوب می شود.
۲-۳-۳ نحوه تشکیل جلسه رسیدگی کمیسیون
۲-۳-۳-۱ محل کار کمیسیون
محل کار کمیسیون تشخیص و دبیرخانه آن در سازمان مسکن و شهر سازی بوده و ارجاع پرونده ها به کمیسیون از طریق دبیر خانه انجام می شود. دبیرخانه فقط در مواردی که پرونده کامل باشد مکلف به ثبت و تشکیل پرونده و ارسال به کمیسیون و انجام استعلام لازم می باشد.
این کمیسیون برای اظهار نظر پس از انجام معاینه محل و ملاحظه نقشه ها و عکس های هوایی و مطالعه پرونده ها ی ثبتی و در صورت لزوم با رعایت عرف مسلم محل مبادرت به اتخاذ تصمیم می نماید.
بدیهی است که کمیسیون تنها طبق صورت جلسات مضبوط در پرونده های ثبتی ومندرجات اسناد مالکیت، نمی تواند اتخاذ تصمیم نماید و نظریه کمیسیون باید مستدل ومتضمن مساحت وموقعیت ومشخصات ثبتی ملک به همراه مستندات کافی باشد. ترسیم کروکی محل وتعیین حدود اربعه ملک و اینکه ملک سابقه زراعت و کشت دارد یا نه نیز باید معلوم ومشخص گردد.
۲-۳-۳-۲ صدور نظریه کمیسیون تشخیص
صدور نظریه کمیسیون تشخیص منوط به اجرای مقدماتی تحت عنوان(شناسایی مقدماتی ) می باشد.
تصمیم کمیسیون وقنی عنوان (نظریه ) دارد که به صورت نوشته دراید نظریه باید حاوی نکات زیر باشد:
۲-۳-۳-۲-۱ مقدمه نظریه
تاریخ صدور نظریه، نام مالک یا مالیت، شماره وپلاک ثبتی مرجع درخواست کننده
۲-۳-۳-۲-۲ اسباب نظریه
پس از مقدمه، کمیسیون علت صدور نظریه خود را استدلال می کند و همچنین دلایل خود را ذکر کرده وموجبات وعلل تصمیم خود را شرح می دهد به نحوی که وقتی نظریه مطالعه می شود علت صدور آن به وضوح مشخص باشد ومالک و یا دادگاه صالح رسیدگی به اعتراض، از دلائل آن آگاه شود. به عبارت دیگرنظریه باید موجه ومدال باشد یعنی جهات و دلائل آن ذکر شوند.
۲-۳-۳-۲-۳ ابلاغ نظریه کمیسیون و موعد آن
قانون زمین شهری راجع به ابلاغ نظریه کمیسیون و موعد آن ساکت است به همین دلیل ماده واحده مجمع تشخیص مصلحت نظام در این خصوص اظهار نظر نموده است به این صورت که (وزارت مسکن و شهر سازی مکلف است نظریه خود را تشخیص نوع زمین اعم از آنچه تاکنون صادر نموده و به آن اعتراض نشده یا آانچه بعداً صادر می نماید به مالکیت اعلام نماید. …). دونکته اساسی در این مصوبه قابل توجه است :
اولاًمنظور از اعلام ابلاغ واقعی است و باید نظریه به خود مالک یا مالکیت ابلاغ واعلام شود.
ثانیاً بر خلاف مقررات راجع به ابلاغ در ق.آ.د.م که ابلاغ بر اساس نشانی ذکر شده در دادخواست صورت می گیرد، در خصوص نظریه کمیسیون در مواردی که نشانی مالک مشخص نیست اگر مالک راسا درخواست نظریه تشخیص نوعیت زمینرا داده باشد در این صورت بید بهوی حضوراً اعلامو ابلاغ شود. واگر سازمان مسکن و شهر سزی راساً جهت شناسایی ملک اقدام کرده باشد دراین صورت باید مفاد نظریه آگهی شود.
۲-۳-۳-۳ انتشار آگهی
برای ضرورت انتشار آگهی قانون گذار دوحالت را پیش بینی نموده است :
الف) در صورت عدم دسترسی به مالک
ب)در صورت استنکاف مالک از دریافت نظریه
۲-۳-۴ نحوه اعتراض به نظریه کمیسیون

۸۴/۱ ± ۳۳/۲۷ ^b

C

۳۷/۱ ± ۷۱/۲۵ ^d

D

۴۳/۱ ± ۵۲/۳۰ ^a

E

^c ۹۵/۲ ± ۳۹/۲۳

F

^d ۲۱/۴ ± ۶۷/۲۶

G

۶۲/۳ ± ۳۱/۲۲ ^d

H

۴۱/۲ ± ۰۳/۲۴ ^c

* میانگین‌های دارای حروف یکسان فاقد تفاوت معنی دار آماری (p< 0.05) هستند.
۴-۵ تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک
۴-۵-۱ توالی یابی
جهت بررسی بیشتر و تایید چند شکلی در جایگاه ژن هورمون رشد GH-2 ماهی سفید تکثیر شده از هر الگوی باندی یک نمونه برای تعیین توالی ارسال شد. نتیجه توالی نمونه‌ها در شکل ۴-۶ آمده است. نتایج تعیین توالی علاوه بر تایید قطعه مورد نظر، نشان داد که در الگوی باندی C نه SNP به صورت چند شکلی‌های T به G در ناحیه ۸۲ جفت بازی، A به C در ناحیه ۱۱۳ جفت بازی، G به A در ناحیه ۲۰۷ جفت بازی، G به A در ناحیه ۲۵۴ جفت بازی، G به A در ناحیه ۲۶۹ جفت بازی، G به A در ناحیه ۲۹۶ جفت بازی، A به G در ناحیه ۳۰۷ جفت بازی، C به A در ناحیه ۳۰۸ جفت بازی و G به A در ناحیه ۳۴۶ جفت بازی قطعه تکثیر شده رخ داده است. همچنین در ناحیه ۳۶۶ جفت بازی در الگوی باندی B یک جهش از نوع حذف مشاهده شد. این SNP ها در مقایسه با الگوی باندی A ماهی سفید است (شکل ۴-۷) (نمودار ۴-۱). همچنین توالی به دست آمده از ماهی سفید با توالی‌های ثبت شده از دیگر ماهیان خانواده کپور در بانک ژنی^[۶۳] BLAST شد که درصد هم‌پوشانی آن‌ها در پیوست آمده است. به دلیل یکسان بودن درصدهای هم‌پوشانی توالی هر سه الگوی باندی فقط یک نمونه از آن آورده شده است.

( اینجا فقط تکه ای از متن فایل پایان نامه درج شده است. برای خرید متن کامل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت feko.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. )

۴-۵-۲ مقایسه توالی GH-2 ماهی سفید و ماهی کپور معمولی
توالی­ الگوهای باندی مشاهده شده در جایگاه GH-2 ماهی سفید با توالی ثبت شده از ماهی کپور معمولی مورد مقایسه قرار گرفت که نتایج آن در شکل ۴-۷ آمده است.
توالی الگوی باندی C:
GGAAGCTTAACCCCAACCAGCTCACTGAGAAGGGCATCANCGTGCTCATCAAGGTGAGAGAGATCCGATTTATTCTAGGCTACTTTCGTTTTTTTTTAAACAATGTGTCTAGGGGTCGTATCAGGAGGTGTGATGACATCTTCCCATCTTGTGGGCTTATTTGGATAGCTATTCCATAATTTGCCATTTGTATCTGCACAGGGATGTCTGGATGGTCAACCAAACATGGATGATAACAACTCCCTACCGCTGCCTTTTGAGGATTTCTACTTGACCATGGGGGAAAGCAGCGTCAGAGAAAGCTTCCGTCTTCTGGCTTGCTTCAAAAAGGACATGCGAAAGGTGGAAACTTACCTGAGGGTTGCAAATTGCAGGAAATCCCTGGATTCCAACTGCACCCTGTAGA
توالی الگوی باندی B:
GGAAGCTTAACCCCAACCAGCTCACTGAGAAGGGCATCAGCGTGCTCATCAAGGTGAGAGAGATCCGATTTATTCTAGGCTACTTTCGTTTTTTTTTAAACAATGTGTCTAGTGGTCGTATCAGGAGGTGTGATGACATCTTCACATCTTGTGGGCTTATTTGGATAGCTATTCCATAATTTGCCATTTGTATCTGCACAGGGATGTCTGGATGGTCAACCAAACATGGATGATAACGACTCCCTACCGCTGCCTTTTGAGGATTTCTACTTGACCATGGGGGAGAGCAGCGTCAGAGAGAGCTTCCGTCTTCTGGCTTGCTTCAAGAAGGACATGCACAAGGTGGAAACTTACCTGAGGGTTGCAAATTGCAGGAGATCCCTGGATTCCAACTGCCCCTGTAGA
توالی الگوی باندی A:
GGAAGCTTAACCCCAACCAGCTCACTGAGAAGGGCATCAGCGTGCTCATCAAGGTGAGAGAGATCCGATTTATTCTAGGCTACTTTCGTTTTTTTTTAAACAATGTGTCTAGTGGTCGTATCAGGAGGTGTGATGACATCTTCACATCTTGTGGGCTTATTTGGATAGCTATTCCATAATTTGCCATTTGTATCTGCACAGGGATGTCTGGATGGTCAACCAAACATGGATGATAACGACTCCCTACCGCTGCCTTTTGAGGATTTCTACTTGACCATGGGGGAGAGCAGCGTCAGAGAGAGCTTCCGTCTTCTGGCTTGCTTCAAGAAGGACATGCACAAGGTGGAAACTTACCTGAGGGTTGCAAATTGCAGGAGATCCCTGGATTCCAACTGCACCCTGTAGA
شکل ۴-۶ مقابسه توالی‌ها بین نمونه‌های ماهی سفید با ژنوتیپ دارای الگوهای باندی A، B و C
شکل ۴-۷ هم ترازی سه نمونه ارسال شده ماهی سفید برای توالی یابی.
فلش‌های آبی نشان دهنده قسمت‌های جهش یافته در الگوی باندی C و B نسبت به الگوی باندی A هستند و فلش‌های قرمز تفاوت الگوهای باندی ماهی سفید را با توالی ماهی کپور معمولی نشان می‌دهد. نمونه ۶۶، ۴ و ۱ به ترتیب الگوهای باندی A، B و C هستند. همچنین Accession number، EU340137 مربوط به توالی GH-2 کپور معمولی است.

فصل چهارم
جمع­بندی و نتیجه ­گیری
۴-۱ مقدمه
هدف اصلی سیستم تحمل خطا، بهبود اتکاپذیری سیستم است. لذا در کلیه­ سیستم­ها در نظر گرفتن بحث اتکاپذیری ضروری است. در این فصل ابتدا مفاهیم اتکاپذیری به همراه نحوه محاسبه اتکاپذیری شرح داده می­شوند که این مطالب برگرفته از منبع [۸۵] می­باشند. در نهایت قابلیت اطمینان گره­های Body Node، Master Node و Mobile Node محاسبه و مقایسه می­ شود. همچنین قابلیت اطمینان برای معماری سه لایه­ای ارائه شده، مورد ارزیابی وتحلیل قرار می­گیرد.

( اینجا فقط تکه ای از متن فایل پایان نامه درج شده است. برای خرید متن کامل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت feko.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. )

۴-۲ تعاریف پایه
در بخش­های آتی λ،µ و C که بترتیب نمادهای نرخ خرابی، نرخ تعمیر و پوشش خطا هستند، به دفعات مورد استفاده قرار می­گیرند. لذا در ادامه به شرح این موارد پرداخته می­ شود.
نرخ خرابی یا λ، تعداد خرابی­ها را در هر واحد زمان پیش ­بینی می­ کند. به عنوان مثال اگر خرابی­های یک پردازنده به صورت میانگین هر هزار ساعت یکبار باشد، آنگاه .
یک تخمین خام از نرخ خرابی سیستم می ­تواند بوسیله جمع نرخ خرابی مؤلفه­ ها(λ_iها) به صورت زیر، انجام ­گیرد. لازم به ذکر است که n تعداد مؤلفه­ های سیستم است.
رابطه (۴-۱):
شایان ذکر است که در طرف مقابل نرخ خرابی نرخ تعمیر وجود دارد. نرخ تعمیر که توسط µ مشخص می­ شود به تعداد تعمیر­ها در واحد زمان اشاره دارد.
پوشش خطا را که با C نشان می­ دهند، یعنی احتمال اینکه با وجود خطا، فعالیت­های مورد انتظار سیستم انجام شوند؛ بگونه­ای که سیستم با شکست مواجه نشود. در ادامه چند پوشش خطا معرفی می­ شود.
پوشش کشف خطا: (وجود خطا | کشف خطا)C=P
پوشش مکان­ یابی خطا: (وجود خطا | مکان یابی خطا)C=P
پوشش محدودسازی خطا: (وجود خطا | محدودسازی خطا)C=P
پوشش ریکاوری خطا: (وجود خطا | ریکاوری خطا)C=P
۴-۳ اتکاپذیری
اتکاپذیری یعنی مقدار توانایی یک سیستم در فراهم کردن سرویس­هایی که قابلیت اطمینان قابل قبول دارند.
اتکاپذیری شامل ویژگی­هایی از قبیل قابلیت اطمینان، دسترس­پذیری، ایمنی، قابلیت نگهداری و آزمون­پذیری، می­باشد. از بین این ویژگی­ها قابلیت اطمینان، دسترس­پذیری و ایمنی مهم می­باشند. با توجه به کاربرد، یکی یا بیشتر از این ویژگی­ها برای ارزیابی رفتار سیستم مناسب است. به طور مثال برای یک سیستم ATM^[72]، قابلیت دسترس­پذیری و برای یک سیستم کنترل نیروگاه اتمی، ایمنی مهم است؛ این در حالیست که برای معماری سه لایه­ای ارائه شده قابلیت اطمینان حائز اهمیت می­باشد.
قابلیت اطمینان^[۷۳]: قابلیت اطمینان را با R(t) نمایش می­ دهند. یعنی احتمال شرطی اینکه سیستم در بازه­ی زمانی [۰,t] بدون نقص و خطا کار کند به شرط اینکه سیستم در زمان «۰» بصورت صحیح در حال کار بوده باشد. در واقع، قابلیت اطمینان یک معیار برای تحویل پیوسته­ی سرویس به صورت صحیح می­باشد. شایان ذکر است که اگر سیستمی بخواهد بدون هیچ­گونه وقفه­ای در حال انجام عملیات باشد، نیاز به قابلیت اطمینان بالا دارد.
دسترس­پذیری^[۷۴]: در برخی کاربردها تعداد خرابی­ها و زمان مورد نیاز برای تعمیر خرابی­ها مهم است. در چنین کاربردهایی دسترس­پذیری اهمیت فراوانی دارد. دسترس­پذیری را که با A(t) نشان می­ دهند، یعنی احتمال اینکه در زمان t، سیستم در حال انجام عملیات به صورت صحیح باشد. به بیانی A(T) میانگین دسترس­پذیری در بازه­ی[۰,T]است که بازه فوق می ­تواند طول عمر سیستم یا زمان اتمام یک کار خاص باشد.
رابطه (۴-۲):
ایمنی^[۷۵]: در بحث ایمنی شکست­ها به دو دسته­ی شکست­های ایمن و شکست­های غیر ایمن تقسیم می­شوند. شکست­های ایمن یعنی با وقوع شکست اتفاق ناگواری رخ ندهد. این در حالیست که در شکست غیر ایمن، اتفاق ناگواری رخ می­دهد، برای مثال فاجعه نیروگاه اتمی چرنوبیل^[۷۶] نمونه ­ای از این نوع شکست است. ایمنی را که با S(t) نشان می­ دهند یعنی احتمال اینکه سیستم یا بصورت صحیح کار کند یا در حالت­های شکست ایمن^[۷۷]، سیستم ادامه انجام عملیات خود را قطع کند.
۴-۴ محاسبه­ی اتکاپذیری با بهره گرفتن از بلوک دیاگرام­های قابلیت اطمینان
به منظور محاسبه­ی اتکاپذیری می­توان از دو روش بلوک دیاگرام­های قابلیت اطمینان و فرایندهای مارکف استفاده کرد. در ادامه معماری سه لایه­ای ارائه شده با بهره گرفتن از بلوک دیاگرام­های قابلیت اطمینان مورد ارزیابی قرار می­گیرد؛ از اینرو در ادامه به شرح کامل این روش پرداخته می­ شود. این درحالیست که روش فرایندهای مارکف بصورت مختصر در بخش افزونگی standby شرح داده می­ شود.
محاسبه قابلیت اطمینان: محاسبه با این روش نیازمند این است که سیستم به دو قسمت سری و موازی تقسیم شود. بعد قابلیت ­های اطمینان­ قسمت­ های فوق که همان Rها هستند، محاسبه ­شوند. سرانجام، جواب کلی از قابلیت ­های اطمینان­ بخش­ها، تشکیل می­ شود. برای یک سیستم با n مؤلفه، که R_i(t) قابلیت اطمینان مؤلفه­ی iام است، قابلیت اطمینان سیستم به صورت زیر محاسبه می­ شود.
رابطه (۴-۳):
برای یک ساختار سری

برای یک ساختار موازی
برای یک سیستم در حالت سری، باید همه مؤلفه­ های سیستم در حال اجرا و عملیاتی باشند تا سیستم بتواند بصورت صحیح کار کند از اینرو .
اما برای یک سیستم در حالت موازی، فقط یکی از مؤلفه­ ها نیاز دارد که عملیاتی باشد. بنابراین عدم قابلیت اطمینان^[۷۸] یک سیستم موازی برابر است با احتمال اینکه همه n مؤلفه خراب شوند، یعنی و در نتیجه قابلیت اطمینان از رابطه بدست می ­آید.
محاسبه­ی دسترس­پذیری: اگر فرض شود که زمان­های خرابی و تعمیر مستقل از یکدیگر هستند، آنگاه می­توان به منظور محاسبه­ی دسترس­پذیری سیستم از بلوک دیاگرام­های قابلیت اطمینان استفاده کرد. این وضعیت زمانی رخ می­دهد که سیستم به اندازه­ کافی منابع افزونه به منظور تعمیر همزمان همه مؤلفه­ های معیوب دارد.
برای یک سیستم با n مؤلفه که A_i(t) دسترس­پذیری مؤلفه­ی iام است، دسترس­پذیری کلی سیستم بصورت زیر است.
رابطه (۴-۴):
برای یک ساختار سری

برای یک ساختار موازی
برای یک سیستم در حالت سری، باید همه مؤلفه­ های سیستم در حال اجرا و عملیاتی باشند تا سیستم بتواند بصورت صحیح کار کند از اینرو .
اما برای یک سیستم در حالت موازی، فقط یکی از مؤلفه­ ها نیاز دارد که عملیاتی باشد. در نتیجه دسترس­پذیری از رابطه بدست می ­آید.
۴-۵ افزونگی TMR
روش­های افزونگی غیرفعال از قبیل TMR و NMR بجای کشف خطا، آنها را می­پوشانند بگونه­ای که با وجود خطا، مقادیر صحیحی در خروجی پدیدار می­ شود.
ارزیابی قابلیت اطمینان: یک سیستم TMR تا زمانی بصورت صحیح کار می­ کند که حداقل دو ماژول از سه ماژول آن بصورت صحیح کار کنند. با فرض اینکه رأی دهنده بی­عیب باشد، قابلیت اطمینان یک سیستم TMR به شرح زیر است.
رابطه (۴-۵): R_TMR= R₁R₂R₃ + (۱-R₁)R₂R₃ + R₁(1-R₂)R₃ + R₁R₂(1-R₃)
R₁R₂R₃ یعنی احتمال اینکه هر سه ماژول بی­عیب باشند و به صورت صحیح کار کنند.(۱-R₁)R₂R₃ یعنی احتمال اینکه اولین ماژول خراب و دو ماژول دیگر سالم باشند.R₁(1-R₂)R₃ یعنی احتمال اینکه ماژول دوم خراب و ماژول­های اول و سوم سالم باشند. R₁R₂(1-R₃) یعنی احتمال اینکه ماژول­های اول و دوم بی­عیب و ماژول سوم خراب باشد. اگر R₁=R₂=R₃=R باشد، آنگاه معادله­ بالا به معادله­ R_TMR= 3R² – ۲R³تبدیل می­ شود. از آنجا که نرخ خرابی مؤلفه­ ها در ارزیابی قابلیت اطمینان حائز اهمیت است، می­توان Rها را بر اساس λ و t نوشت. یعنی اگر λ نرخ خرابی ثابت و t زمان باشد، آنگاه R(t)=e^-λt می­باشد. در نتیجه فرمول بالا را می­توان بصورت زیر نوشت.
رابطه (۴-۶): R_TMR(t) = 3e^-2λt – ۲e^-3λt
۴-۶ افزونگی standby
افزونگی­های فعال به منظور دستیابی به تحمل خطا، ابتدا خطاهای رخ داده در سیستم را شناسایی می­ کنند، سپس عملیات لازم را به منظور ریکاوری سیستم و برگشت سیستم به حالت عملیاتی، انجام می­ دهند.در سیستم­های standby بین مؤلفه­ های سیستم وابستگی وجود دارد، از اینرو اینگونه سیستم­ها با بهره گرفتن از مدل­های مارکف آنالیز می­شوند.
محاسبه با بهره گرفتن از فرایندهای مارکف: فرایندهای مارکف برای ارزیابی وابستگی سیستم، مورد استفاده قرار می­گیرند. هدف فرایندهای مارکف محاسبه­ی P_i(t) است، یعنی احتمال اینکه سیتم در زمان t در وضعیت i باشد. اگر در وضعیت ۱، تمامی مؤلفه­ ها در حال کار و در محیط عملیاتی باشند و با فرض اینکه در زمان t=0، سیستم در وضعیت یک است آنگاه P₁(0)=1 . از اینرو سیستم در هر زمانی فقط می ­تواند در یک حالت باشد یعنی P_i(0), پس

با دقت در رابطه­ (‏۳‑۳۵)، درمی­یابیم همان معادله­ SDRE می­باشد با رجوع به معادله­ ریکاتی معمولی ملاحظه می­ شود؛ که فرق اصلی این معادله با آن، در وابستگی این معادله به متغیر حالت می­باشد. حال با توجه به روابط (‏۳‑۱۳)، (‏۳‑۲۴)، (‏۳‑۲۶) و (‏۳‑۳۴) خواهیم داشت:

‏۳‑۳۷

بدین ترتیب با حل معادلات (‏۳‑۳۵) و (‏۳‑۳۶) می­توان ورودی کنترلی حلقه بسته را یافت. نکته قابل ذکر دیگر این­ است که در صورتی که به سیستم اغتشاش وارد نشود، همانطور که در بسیاری از کتاب­های کنترل بهینه [۲۶] ذکر شده است عبارتهایی شامل حذف می­گردد.
در ادامه دو روش تکرار برای حل معادلات SDRE در حالت زمان محدود و نامحدود را بیان می­کنیم.

(( اینجا فقط تکه ای از متن درج شده است. برای خرید متن کامل فایل پایان نامه با فرمت ورد می توانید به سایت feko.ir مراجعه نمایید و کلمه کلیدی مورد نظرتان را جستجو نمایید. ))

روش­های حل معادله ریکاتی وابسته به حالت (SDRE)
در معادله­ ریکاتی معمولی، تنها مجهول P(t) بود. اما برای طراحی سیستمی با اغتشاش که مد نظر در این کار می­باشد، باید دو مجهولP(t) و را به­دست آوریم. باید برای بدست آوردن این دو در زمان دلخواه، آن­ها را به صورت عقب­گرد^[۸۲] از زمان­های نهایی حل نمود.اما در این­جا ضرایب با توجه به نقطه­ی x که در آن هستیم تغییر می­ کنند. پس برای اجرای فرمان عقب­گرد، به منظور حل معادله­ SDRE، نیاز به مقدار متغیر حالت در هر زمان دلخواه داریم. مشکل از این جا شروع می­ شود که ما تنها مقدار اولیه­ x را داریم. هم­چنین برای به­روزکردن^[۸۳] متغیر حالت نیاز به ورودی می­باشد که خود نیاز به مقدار P و در زمان مورد نیاز وابسته است. لذا کار برای حل معادلات SDRE به مراتب دشوارتر از معادله­ ریکاتی خواهد شد. تاکنون روش­های متعددی برای حل این نوع معادلات ارائه شده است. ما در این کار جرثقیل حامل کانتینر را با دو روش زمان محدود و نامحدود برای حل معادله­ SDREکنترل می­کنیم.
ابتدا روش حل تکرار معادله­ SDRE، ارائه شده توسط دکتر خالوزاده[۲۶]، که توسط مهندس بیک­زاده درستی آن به اثبات رسیده [۳۰]، را شرح می­دهیم. حسن این روش، در سادگی پیاده­سازی آن است. این روش برای سیستم­های افاین به کار می­رود. روش کار به این صورت است که ابتدا سیستم را بدون ورودی فرض می­کنیم. در نتیجه متغیرهای حالت را تا زمان نهایی، به صورت زیر به­دست می­آوریم:

‏۳‑۳۸

سپس معادله­ SDRE را به کمک متغیرهای حالت بدست آمده از رابطه­ (‏۳‑۳۸)، به صور عقب­گرد حل می­کنیم. در نتیجه تمامی P و ها در رابطه­ های (‏۳‑۳۵‏) و (۳‑۳۶) بدست می­آیند. لازم به ذکر است که در حل این معادله به صورت عقب­گرد، از روش حل انتگرالی در معادلات ریکاتی تقلید می­کنیم. یعنی در رابطه­ (‏۳‑۳۵‏) و (۳‑۳۶) ، به جای و ، به ترتیب و را بازنویسی می­کنیم [۳۱]. سپس معادله را بر حسب P(t-1) و ، به صورت عقب­گرد حل می­کنیم. حال با داشتن Pها، قادر به بدست آوردن سیگنال کنترلی K از طریق رابطه­ (‏۳‑۳۴) خواهیم بود. سپس با توجه به مقادیر بدست آمده و استفاده از آن در رابطه­ (‏۳‑۳۷) ورودی کنترلی بدست می ­آید.
دوباره مراحل گفته شده را تکرار می­کنیم، ولی این بار در رابطه­ (‏۳‑۳۸) از ورودی­های بدست امده از رابطه­ (‏۳‑۳۴)، برای به روز کردن متغیرهای حالت سیستم استفاده می­کنیم. این تکرار را آنقدر ادامه می­کنیم تا تغییرات u قابل چشم­پوشی بشود.
روش حل این معادله در حالت نامحدود به این شکل است که با داشتن x₀، ماتریس­های A(x₀) و B(x₀) را خواهیم داشت و در نتیجه می­توان معادله­ ریکاتی را به صورت یک معادله­ ریکاتی معمولی بر حسب ماتریس­های ثابت A(x₀) و B(x₀) به صورت نامحدود حل کرد. سپس با مقدار P و و در نتیجه ورودی کنترلی بدست آمده از حل مساله­ی کنترل بهینه خطی(LQR) در این مرحله؛ مقادیر حالت سیستم را به روز نمود. در مرحله­ بعد مساله­ی کنترل بهینه­ خطی را به طریق گفته شده بر حسب ماتریسهای ثابتA(x₁) و B(x₁) حل نموده و این مراحل را در هر زمان تکرار نمود.
کنترل­ کننده و رویت­گر SDRE
در صورت عدم دسترسی به حالات سیستم به رویت­گرها نیاز می­باشد. در طراحی تخمین­گر بهینه باید آن­ها را به صورت دوگان^[۸۴] کنترل­ کننده­ های بهینه در نظر بگیریم [۳۱]. سپس، همانند روش خطی، آن را با کنترل­ کننده ترکیب می­کنیم. تابعی را به صورت ز یر در نظر می­گیریم:

‏۳‑۳۹

حال دوگان آن چه را که برای ورودی بهینه ا نجام دادیم، تکرار می­کنیم. تنها به تر تیب به جای A، B و K از A^T ، C^T و L^T استفاده می­کنیم. بنابراین معادلات SDRE با وجود اغتشاش چنین خواهد شد:

‏۳‑۴۰